qPCR 계산기
상대적 유전자 발현 분석을 위한 ΔΔCt(Livak) 방법을 구현한 무료 온라인 qPCR 계산기입니다. 타겟 및 레퍼런스 유전자의 Ct 값을 입력하고, 오차 막대가 포함된 발현 변화를 시각화하며, 표준곡선에서 PCR 효율을 확인하고, 결과를 CSV로 내보낼 수 있습니다.
| 샘플 이름 | 타겟 유전자 Ct | 레퍼런스 유전자 Ct | 대조군 | |
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qPCR 계산기란?
qPCR(정량 PCR) 계산기는 실시간 PCR 데이터를 분석하여 샘플 간의 상대적 유전자 발현 수준을 결정합니다. ΔΔCt 방법(Livak 방법)은 레퍼런스 하우스키핑 유전자로 정규화된 타겟 유전자의 역치 사이클(Ct) 값을 비교한 다음, 대조군 샘플에 대한 발현 변화를 계산합니다. 이것은 실험 조건에서 유전자가 얼마나 상향 또는 하향 조절되는지 측정하는 표준 접근법입니다.
사용 방법
- 타겟 및 레퍼런스(하우스키핑) 유전자의 Ct 값과 함께 샘플을 추가하세요
- 최소 하나의 샘플을 대조군(캘리브레이터)으로 표시하세요
- 분석을 클릭하여 각 샘플의 ΔCt, ΔΔCt, 발현 변화를 계산하세요
- 발현 수준을 비교하는 발현 변화 막대 차트를 확인하세요
- 선택적으로 효율 탭에서 표준곡선 데이터의 PCR 효율을 확인하세요
- 추가 분석을 위해 결과를 CSV로 내보내세요
자주 묻는 질문
ΔΔCt 방법이란 무엇인가요?
ΔΔCt(델타-델타-Ct) 방법은 두 단계로 상대적 유전자 발현을 계산합니다: (1) ΔCt = Ct(타겟) - Ct(레퍼런스)로 하우스키핑 유전자에 정규화, (2) ΔΔCt = ΔCt(샘플) - ΔCt(대조군)으로 대조군 샘플에 정규화. 발현 변화 = 2^(-ΔΔCt). 이는 ~100% PCR 효율을 가정합니다.
허용 가능한 PCR 효율은 얼마인가요?
이상적인 PCR 효율은 100%(사이클당 2배)입니다. 허용 범위는 90-110%(효율 0.9-1.1)입니다. 효율은 표준곡선의 기울기로 계산됩니다: E = 10^(-1/slope) - 1. 기울기 -3.322는 100% 효율을 나타냅니다.
Livak 대신 Pfaffl 방법은 언제 사용해야 하나요?
타겟과 레퍼런스 유전자의 PCR 효율이 크게 다를 때(5% 이상) Pfaffl 방법을 사용하세요. Pfaffl 방법은 개별 유전자 효율을 반영합니다. Livak 방법은 두 유전자 모두 ~100% 효율을 가정합니다.